Nuo 2009 mokslo metų pradžios mokykloje vykdoma Olweus patyčių prevencijos programa, kurios esmė išmokti mokykloje atpažinti, pastebėti patyčias ir tinkamai į jas reaguoti.
Nuo 2011 m. 2 metus buvo diegiama Olweus programos kokybės užtikrinimo sistema OPKUS. 2013 m. pavasarį vykdyto audito metu patvirtinta, kad mokykla laikosi visų Olweus programos standarto (OPS) ir Olweus programos Kokybės užtikrinimo sistemos (OPKUS) reikalavimų. Vadovaudamasi jais, mokykla vykdo sistemingą patyčių prevenciją ir sprendžia įtariamų ar patvirtintų patyčių atvejus.
2013 m. spalio 7 d. specialiosios pedagogikos ir psichologijos centras ir Olweus International Ltd. Jonavos Justino Vareikio progimnazijai suteikė „Olweus mokyklos“ vardą 2013–2014 ir 2014–2015 mokslo metams. Po pakartotinių auditų "Olweus mokyklos" vardas buvo pratęstas: 2015–2016 ir 2016–2017, 2017-2018, 2018-2019, 2019–2020 ir 2020–2021 mokslo metams.
Po 2022 m. pavasarį įvykusio Olweus programos kokybės užtikrinimo sistemos audito Nacionalinės švietimo agentūros direktoriaus įsakymu Jonavos Justino Vareikio progimnazijai suteiktas Olweus mokyklos vardas 2022-2023 ir 2023-2024 mokslo metams.
Įgyvendinant Olweus programos standartą, mokyklos bendruomenė privalo:
1) Mes nesityčiosime iš kitų.
2) Mes stengsimės padėti tiems, iš kurių tyčiojasi.
3) Mes stengsimės bendrauti su tais, kurie yra atstumti.
4) Jei sužinosime, kad iš kažko tyčiojamasi - pasakysime suaugusiems ir mokykloje, ir namuose.
Olweus programos koordinacinio komiteto nariai:
MSG grupių vadovai:
I grupė – Irena Beinorienė, Neringa Butienė
II grupė – Lidija Grižienė, Birutė Pilipavičienė
III grupė – Daiva Puišienė, Diana Riaubienė
IV grupė – Jadvyga Kulakauskienė, Lina Nekrošienė
V grupė – Irena Šmorgūnienė, Jūratė Stankaitienė
Olweus programos instruktorė mokykloje – Vida Šerėnienė
Olweus programos koordinatorė mokykloje – Inga Jurevičiūtė
Daugiau informacijos apie Olweus programą galima rasti interneto svetainėje www.nsa.smm.lt/